MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae Taiwan19F-14 chromosome

Total Repeats: 34948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012469	GAAA	2	8	199	206	75 %	0 %	25 %	0 %	225860013
2	NC_012469	AAGA	2	8	240	247	75 %	0 %	25 %	0 %	225860013
3	NC_012469	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860013
4	NC_012469	GAAATG	2	12	338	349	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	225860013
5	NC_012469	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860013
6	NC_012469	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860013
7	NC_012469	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860013
8	NC_012469	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860013
9	NC_012469	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	225860013
10	NC_012469	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860013
11	NC_012469	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860013
12	NC_012469	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	225860013
13	NC_012469	A	6	6	715	720	100 %	0 %	0 %	0 %	225860013
14	NC_012469	AT	3	6	742	747	50 %	50 %	0 %	0 %	225860013
15	NC_012469	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860013
16	NC_012469	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860013
17	NC_012469	A	7	7	871	877	100 %	0 %	0 %	0 %	225860013
18	NC_012469	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860013
19	NC_012469	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860013
20	NC_012469	A	8	8	1195	1202	100 %	0 %	0 %	0 %	225860013
21	NC_012469	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860013
22	NC_012469	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860013
23	NC_012469	GGAA	2	8	1434	1441	50 %	0 %	50 %	0 %	225860013
24	NC_012469	TCAT	2	8	1467	1474	25 %	50 %	0 %	25 %	225860013
25	NC_012469	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	225860013
26	NC_012469	TGAT	2	8	1497	1504	25 %	50 %	25 %	0 %	225860013
27	NC_012469	AATC	2	8	1533	1540	50 %	25 %	0 %	25 %	225860013
28	NC_012469	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860013
29	NC_012469	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860014
30	NC_012469	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	225860014
31	NC_012469	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860014
32	NC_012469	AG	3	6	1772	1777	50 %	0 %	50 %	0 %	225860014
33	NC_012469	A	7	7	1895	1901	100 %	0 %	0 %	0 %	225860014
34	NC_012469	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860014
35	NC_012469	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860014
36	NC_012469	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860014
37	NC_012469	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860014
38	NC_012469	AGCA	2	8	2106	2113	50 %	0 %	25 %	25 %	225860014
39	NC_012469	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860014
40	NC_012469	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860014
41	NC_012469	AG	3	6	2184	2189	50 %	0 %	50 %	0 %	225860014
42	NC_012469	A	6	6	2278	2283	100 %	0 %	0 %	0 %	225860014
43	NC_012469	A	7	7	2294	2300	100 %	0 %	0 %	0 %	225860014
44	NC_012469	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860014
45	NC_012469	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860014
46	NC_012469	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860014
47	NC_012469	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860014
48	NC_012469	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	225860014
49	NC_012469	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860014
50	NC_012469	ACTT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	225860014
51	NC_012469	GATT	2	8	2718	2725	25 %	50 %	25 %	0 %	225860014
52	NC_012469	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860014
53	NC_012469	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860015
54	NC_012469	A	6	6	2948	2953	100 %	0 %	0 %	0 %	225860015
55	NC_012469	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	225860015
56	NC_012469	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860015
57	NC_012469	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860015
58	NC_012469	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860015
59	NC_012469	AATC	2	8	3561	3568	50 %	25 %	0 %	25 %	225860016
60	NC_012469	ACCAG	2	10	3576	3585	40 %	0 %	20 %	40 %	225860016
61	NC_012469	CTAT	2	8	3636	3643	25 %	50 %	0 %	25 %	225860016
62	NC_012469	TTC	2	6	3644	3649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860016
63	NC_012469	TC	3	6	3749	3754	0 %	50 %	0 %	50 %	225860016
64	NC_012469	ATT	2	6	3815	3820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860016
65	NC_012469	TTGT	2	8	3841	3848	0 %	75 %	25 %	0 %	225860016
66	NC_012469	ATA	2	6	3879	3884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860016
67	NC_012469	A	6	6	4101	4106	100 %	0 %	0 %	0 %	225860017
68	NC_012469	GGGA	2	8	4143	4150	25 %	0 %	75 %	0 %	225860017
69	NC_012469	TC	3	6	4203	4208	0 %	50 %	0 %	50 %	225860017
70	NC_012469	CAA	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860017
71	NC_012469	TCC	2	6	4608	4613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860018
72	NC_012469	CTT	3	9	4684	4692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860018
73	NC_012469	T	6	6	4725	4730	0 %	100 %	0 %	0 %	225860018
74	NC_012469	CCTAT	2	10	4734	4743	20 %	40 %	0 %	40 %	225860018
75	NC_012469	TCA	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860018
76	NC_012469	ACC	2	6	4803	4808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860018
77	NC_012469	TGT	2	6	4945	4950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860019
78	NC_012469	GTA	2	6	5032	5037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860019
79	NC_012469	GTT	2	6	5048	5053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860019
80	NC_012469	T	7	7	5145	5151	0 %	100 %	0 %	0 %	225860019
81	NC_012469	T	7	7	5291	5297	0 %	100 %	0 %	0 %	225860020
82	NC_012469	TAA	2	6	5341	5346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860020
83	NC_012469	ATC	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860020
84	NC_012469	AAT	2	6	5571	5576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860021
85	NC_012469	AAGC	2	8	5698	5705	50 %	0 %	25 %	25 %	225860021
86	NC_012469	TTC	2	6	5812	5817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860021
87	NC_012469	TCC	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860021
88	NC_012469	CTA	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860021
89	NC_012469	TAC	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860021
90	NC_012469	TGT	2	6	6084	6089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860021
91	NC_012469	TCA	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860022
92	NC_012469	TCT	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860022
93	NC_012469	CCTAA	2	10	6693	6702	40 %	20 %	0 %	40 %	225860023
94	NC_012469	ATCTTC	2	12	6703	6714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	225860023
95	NC_012469	CCGTT	2	10	6798	6807	0 %	40 %	20 %	40 %	225860023
96	NC_012469	GTT	2	6	6830	6835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860023
97	NC_012469	T	6	6	6834	6839	0 %	100 %	0 %	0 %	225860023
98	NC_012469	ATTT	2	8	6918	6925	25 %	75 %	0 %	0 %	225860023
99	NC_012469	ATCGTT	2	12	7006	7017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	225860023
100	NC_012469	T	6	6	7035	7040	0 %	100 %	0 %	0 %	225860023
101	NC_012469	AGC	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860023
102	NC_012469	TTCT	2	8	7153	7160	0 %	75 %	0 %	25 %	225860023
103	NC_012469	ACC	2	6	7206	7211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860023
104	NC_012469	T	7	7	7296	7302	0 %	100 %	0 %	0 %	225860023
105	NC_012469	ATC	2	6	7375	7380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860023
106	NC_012469	TTCC	2	8	7398	7405	0 %	50 %	0 %	50 %	225860023
107	NC_012469	ATT	2	6	7510	7515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860023
108	NC_012469	CTT	2	6	7602	7607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860023
109	NC_012469	ATCAAA	2	12	7639	7650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	225860023
110	NC_012469	AT	3	6	7781	7786	50 %	50 %	0 %	0 %	225860023
111	NC_012469	GGT	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860023
112	NC_012469	TTTC	2	8	8065	8072	0 %	75 %	0 %	25 %	225860023
113	NC_012469	CTA	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860023
114	NC_012469	AGG	2	6	8155	8160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	225860023
115	NC_012469	CT	3	6	8170	8175	0 %	50 %	0 %	50 %	225860023
116	NC_012469	TTC	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860023
117	NC_012469	CT	3	6	8233	8238	0 %	50 %	0 %	50 %	225860023
118	NC_012469	CTC	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860024
119	NC_012469	TTA	2	6	8367	8372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	225860024
120	NC_012469	CCT	2	6	8412	8417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860024
121	NC_012469	AAT	2	6	8447	8452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	225860024
122	NC_012469	AGT	2	6	8501	8506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860024
123	NC_012469	TGT	2	6	8591	8596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860024
124	NC_012469	TAC	2	6	8675	8680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860024
125	NC_012469	TCA	2	6	8701	8706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860024
126	NC_012469	GTT	2	6	8708	8713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860024
127	NC_012469	CAC	2	6	8720	8725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	225860024
128	NC_012469	CTATG	2	10	8746	8755	20 %	40 %	20 %	20 %	225860024
129	NC_012469	CAAA	2	8	8788	8795	75 %	0 %	0 %	25 %	225860024
130	NC_012469	GTC	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	225860024
131	NC_012469	AAATC	2	10	8857	8866	60 %	20 %	0 %	20 %	225860024
132	NC_012469	GTT	2	6	8885	8890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860024
133	NC_012469	TCC	2	6	8964	8969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860024
134	NC_012469	TCAT	2	8	9085	9092	25 %	50 %	0 %	25 %	225860024
135	NC_012469	CGG	2	6	9154	9159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	225860025
136	NC_012469	TATT	2	8	9240	9247	25 %	75 %	0 %	0 %	225860025
137	NC_012469	CCT	2	6	9367	9372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860026
138	NC_012469	TCA	2	6	9406	9411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860026
139	NC_012469	CTC	2	6	9431	9436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860026
140	NC_012469	TGT	2	6	9541	9546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860026
141	NC_012469	ACT	2	6	9552	9557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860026
142	NC_012469	TTCT	2	8	9583	9590	0 %	75 %	0 %	25 %	225860026
143	NC_012469	CTC	2	6	9699	9704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	225860027
144	NC_012469	TTTA	2	8	9714	9721	25 %	75 %	0 %	0 %	225860027
145	NC_012469	CGCT	2	8	9737	9744	0 %	25 %	25 %	50 %	225860027
146	NC_012469	CAA	2	6	9837	9842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860027
147	NC_012469	TCCC	2	8	9970	9977	0 %	25 %	0 %	75 %	225860028
148	NC_012469	AT	3	6	10002	10007	50 %	50 %	0 %	0 %	225860028
149	NC_012469	T	7	7	10081	10087	0 %	100 %	0 %	0 %	225860028
150	NC_012469	GGT	2	6	10096	10101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	225860028
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153	NC_012469	TG	3	6	10149	10154	0 %	50 %	50 %	0 %	225860028
154	NC_012469	TTCA	2	8	10169	10176	25 %	50 %	0 %	25 %	225860028
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156	NC_012469	TG	3	6	10276	10281	0 %	50 %	50 %	0 %	225860029
157	NC_012469	TCTTT	2	10	10307	10316	0 %	80 %	0 %	20 %	225860029
158	NC_012469	ATC	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	225860029
159	NC_012469	TCT	2	6	10423	10428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	225860029
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162	NC_012469	A	6	6	10491	10496	100 %	0 %	0 %	0 %	225860030
163	NC_012469	TGA	2	6	10501	10506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860030
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167	NC_012469	AATC	2	8	10608	10615	50 %	25 %	0 %	25 %	225860031
168	NC_012469	TA	3	6	10629	10634	50 %	50 %	0 %	0 %	225860031
169	NC_012469	T	6	6	10667	10672	0 %	100 %	0 %	0 %	225860031
170	NC_012469	T	6	6	10678	10683	0 %	100 %	0 %	0 %	225860031
171	NC_012469	CATA	2	8	10712	10719	50 %	25 %	0 %	25 %	225860031
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252	NC_012469	ACTC	2	8	16466	16473	25 %	25 %	0 %	50 %	225860041
253	NC_012469	AGC	2	6	16510	16515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	225860041
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256	NC_012469	TGA	2	6	16670	16675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	225860041
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259	NC_012469	A	6	6	16945	16950	100 %	0 %	0 %	0 %	225860041
260	NC_012469	TGT	2	6	16994	16999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	225860042
261	NC_012469	TCAA	2	8	17031	17038	50 %	25 %	0 %	25 %	225860042
262	NC_012469	AAC	2	6	17051	17056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	225860042
263	NC_012469	AAG	2	6	17099	17104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	225860042
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